요도염 및 귀두염 증상이 완화되었으나 중간중간 잔류하는 경우, 원인균 불명의 감염 가능성은 있을까요?

안녕하세요 제가 약 한달 전 즈음에 관계(구강성교) 3일 후에 std12종 검사를 하고 아무 균이 검출 되지 않았으나 요도염 및 귀두염 증상이 있어서 의사선생님이 이런경우는 검출 대상 균이 아닌 잡균 감염이라고 소견 및 진찰을 해주셔서 항생제 처방을 받고 증상도 많이 완화가 되었습니다. 그리고 복용이 끝 날 때에 증상이 없으면 병원에 오지 않아도 된다 하셨는데 그 당시에는 증상이 없었으나 중간중간 증상이 간혈적으로 보이는데(요도 혹은 귀두에 약간의 통증 및 가려움) 증상이 잔류하는 경우도 있나요? 또한 검사당시 3일밖에 안지났어서 원인균을 못찾은게 아닐 까 걱정이 되기도 합니다. 원인균 불명의 감염 같은 경우도 있나요?